不同的光源發射出特定的發射光透過載物的微孔板、光的一部分被物質吸收，從而前后光的強度發生變化，這種特異性的強度變化與被測物濃度呈一定比例關系，能夠定量、定性地檢測結果。該儀器操作簡單，技術成熟，但靈敏度不高，當需要測定不同波段時，需切換不同光源。

顧名思義，此酶標儀用來檢測熒光，特定的激發光照射在被測熒光物質上，繼而被測物進入激發狀態，釋放出發射光，由檢測器記錄發光強度，推導熒光物質的量。優點在于靈敏度高，但由于發射光和激發光強度可能會疊加或減弱，造成測定誤差。

是通過某些生物或化學反應發光，通常會用到熒光素酶，加好試劑和樣品的多孔板放置到酶標儀中，會對其產生的光信號進行檢測，進行定量檢測，靈敏度高于以上兩種酶標儀，動態范圍廣。